询价公告——《LINC-PINT 遗传变异在鼻咽癌治疗中的作用及机制》项目转录组测序分析服务
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公告摘要
各有关单位请与公告中联系人联系，及时参与投标等相关工作，以免错失商业机会。
部分信息内容如下：（查看详细信息请登录）
各供应商：
为开展《LINC-PINT 遗传变异在鼻咽癌治疗中的作用及机制》项目，需要进行转录组测序分析服务，现进行询价，相关事项公告如下：
一、项目概况
*、项目名称：********级课题《LINC-PINT 遗传变异在鼻咽癌治疗中的作用及机制》项目转录组测序分析服务。
*、计划时间安排：****年*月至****年**月，具体以实际项目进行情况为准。
二、经费预算
预算控制金额*.*万元。预计**个样本，按实际样本数结算。
三、项目服务内容及要求
*、样本提取：提取RNA，利用分子生物学先进设备检测RNA样品的纯度、浓度和完整性，以保障使用合格的样品进行转录组测序。样本数：**个。
*、文库构建：
*）引物退火，反转录成cDNA，加上switch oligo；
*）合成互补链；
*）DNA损伤修复和末端修复，磁珠纯化。
*、高通量测序：采用Nanopore三代测序平台完成样本全长转录组测序，每个样品测序产出 clean data均达到*.**GB。
*、信息分析内容
*.*基本分析
数据质控分析、转录本去冗余、比对结果可视化、基因结构优化、可变剪接分析、转录本融合发现、可变多聚腺苷酸化、SSR分析、新基因编码区序列预测、转录因子预测、lncRNA预测、lncRNA靶基因预测、新转录本表达定量、差异表达转录本分析、差异表达基因分析等。
*.*. 差异可变剪接分析
*.*.* PSI-Sigma进行差异可变剪切分析，提供两组样本PSI 值(N Values, T Values）及用于筛选差异可变剪切事件的FDR值及ΔPSI (%)值）。
*.*.* IGV辅助ATAC-Seq可视化分析（提供比对结果bam文件辅助IGV可视化查看）。
四、项目服务成果及交付方式
*、服务成果
乙方基于Nanopore测序技术平台，利用电信号识别碱基序列的三代测序技术，构建全长转录组文库进行建库测序，并获得测序数据。乙方采取以下技术路线进行全长转录组测序分析：样品制备—上机测序—生物信息数据分析。
*、交付方式
最终提交测序数据和项目结题报告。
*、交付时间
乙方在收到样本后开始进行测序和生物信息分析工作，**个工作日内向甲方交付生物信息分析报告；如果需要其他高级数据分析，服务周期相应**；双方沟通时间不计入项目周期。
五、供应方资格要求
（一）供应方须具有独立承担民事责任的能力，严禁任何单位和个人借用其他公司证照参与报价；
（二）供应方须具有包括但不限于经营本询价文件所述服务内容的资质；
（三）报价人及服务团队成员有良好的社会信誉和诚信记录，*年内未受到行业行政主管部门的行政处罚等不良记录，需作出相关书面承诺；
（四）报价人与询价人无利益冲突；
（五）法律、行政法规规定的其他条件。
六、报价要求
（一）报价人报价不得更改，报价包含服务期间所可能发生的一切费用，采购方不再支付其他任何费用。一旦成交，采购人将不会对其报价做出其他补偿；
（二）报价应包含完成本项目的所有费用，报价人漏报、少报的费用，视为此项费用已隐含在报价中，成交后不得再向采购人收取任何费用；
（三）除另有规定外，若出现有关法律、法规和规章有强制性规定但询价文件未列明的情形，则报价人应按照有关法律、法规和规章强制性规定执行；
七、报价文件组成
报价文件采用密封纸质文件递送，报价文件需含以下内容：
（一）营业执照复印件；
（二）法人身份证复印件、若有授权代表请提供身份证复印件及授权委托书；
（三）报价单，需包含项目单价及总价；
（四）无不良记录书面承诺。
以上文件加盖公章，装订成册并加盖骑缝章，一式壹份，用文件袋包装并在文件袋封口处加盖公章密封或由授权代表签字密封，在文件袋正面标明公司全称、联系人及联系电话，邮寄或现场送达。
收货地址：********路**-**号门诊五楼保障保卫部
联系电话：刘老师（收）****-*******
项目响应文件送达截止时间****年*月**日**:**前，逾期送达的或不符合规定的响应文件将被拒绝。
八、评价办法
满足科室基本需求的基础上，按照最低价中标的方法确定成交供应商。
九、付款方式
中标供应商应与医院签订合同。在合同规定的时间内，承包商完成项目，经采购人确认后，承包商开具发票，采购人报销后支付合同款给承包商。
反馈电话：保障保卫部 刘老师****-*******
药剂科 王老师：***********
监督科室：监察审计室 ****-*******
*******
复旦大学附属儿科医院**医院
****年*月**日
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