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2024-fw-003--免规测序服务采购公告
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2024-fw-003--免规测序服务采购公告
发布日期:2024年05月23日 | 标签:
160936556
gonggao
;南宁市
2024.05.23
2024.05.31
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公告摘要
***********招标公司受业主*******委托,于2024年05月23日在招标网发布2024-fw-003--免规测序服务采购公告。
各有关单位请于2024.05.31前与公告中联系人联系,及时参与投标等相关工作,以免错失商业机会。
部分信息内容如下:(查看详细信息请
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)
一、采购项目名称及内容 采购人:**壮族自治区疾病预防控制中心; 采购项目名称:免疫规划检测项目测序服务; 项目编号:****-FW-***; 资金来源:财政资金。 二、项目内容 (一)菌株全基因组测序:**次。 *.样本类型和数量:纯化后的细菌*株 *.DNA提取:采用SDS或STE的方法对样本的基因组DNA 进行提取,之后利用琼脂糖凝胶电泳检测DNA 的纯度和完整性,利用Qubit进行定量。 *.文库构建: 经电泳检测合格的 DNA 样品用 Covaris 超声波破碎仪随机打断成长度约为***bp的片段。处理完成后的DNA片段,使用 NEBNext®Ultra? DNA Library Prep Kitfor Illumina(NEB, USA)试剂盒,经末端修复、加A尾、加测序接头、纯化、PCR扩增等步骤完成整个文库制备。 *.文库检测:文库构建完成后,先使用 Qubit *.* 进行初步定量,稀释文库至 *ng/ul,使用 Agilent对文库的插入片段进行检测,insert size符合预期后,使用 Q-PCR 方法对文库的有效浓度进行准确定量,以保证文库质量。 *.测序和交付平台:使用illumina NovaSeqPE***上机测序,运行智能化交付系统和自动化样本库系统; *.数据质量:原始下机数据测序质量要求: Q**≥**%,Q**≥**%; *.数据量:raw data≥*G/样本; *.数据交付:需要交付clean data; *.周期要求:需要保证项目可加急得到响应,二代测序仪充足≥**台; **.生物信息学分析内容: ① 原始下机数据处理:过滤测序质量值低的reads,保留高质量reads,得到Clean Data; ② 样品组装: 进行基因组组装,得到能反映样品基因组基本情况的序列文件,并对组装结果进行评价; ③ 基因组组分分析 组装完成后,分析样品基因组的成分,包括编码基因、非编码RNA、重复序列、前噬菌体、基因岛、CRISPR等基因组成分的预测; ④ 功能注释 针对编码基因序列进行不同数据库的功能注释,包括常用的KEGG、COG数据库、针对病原微生物的数据库; ⑤ 基因组比较分析 此步骤从基因组、基因两层面分别比较样品与参考基因组的差异,包括共线性分析、基因家族构建、共有/特有基因分析、物种进化树构建。 (二)一代测定服务:***反应。 *.样本为PCR产物和引物,PCR产物未纯化,引物浓度为**μM。 *.★一代测定服务包括:序列测定在技术服务公司实验室完成,对PCR产物纯化,并按照送样者要求的长度进行基因序列测定。将测序结果以图谱形式反馈。 *.★ PCR产物纯化方式:胶回收纯化。 *.测序要求:双向或者单向,送检单会标明。 *.测序序列质量:一个正常的成功反应,能保证测序色谱图文件(*.abi) 峰形清晰,无杂峰,峰值明显。 *.★提供的结果为:测序色谱图文件(*.abi)、终序列、拼接序列(*.fas或*.fasta)。结果反馈地点及数量:按照采购方要求发往指定服务地点。 *.检测中使用的试剂和耗材均需为优质无菌。 *.开展服务的实验室符合二级生物安全实验室要求,具备生物安全柜。 *.凡该样本在检测过程中发生的污染和各类纠纷,后果由服务商承担。 **.★服务商负责样品运输,样本运输必须在带冰条件下运输。运输过程中造成的损失、污染、及各类纠纷,后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。 **.样本交接:根据采购方的要求,在**壮族自治区疾病预防控制中心不定期进行标本交接。 **.服务商及技术服务公司未经采购方同意,不能将剩余样本另作他用或转让给第三方使用,根据采购方要求进行保存返回或按照相关规定处理。 (三)提供的成果 包含但不限于:出具检测原始数据、汇总结果(Excel文件列出标本名称以及对应的各指标结果)、样本接收单。 (四)提交服务成果时间 收到样本并质检合格后,一代测定服务于*~*个工作日内完成检测并返回结果;菌株全基因组测序于**个工作日内完成所有项目分析内容。售后服务包括能提供现场报告解读。若样本未检出或峰图有杂峰等无法分析,重测也如此,视为此次测序无效,采购方将不支付相应费用。如连续三次未及时反馈结果,采购方有权拒绝支付相应费用,并追究样本损失。 (五)其他要求: *.开展服务的实验室符合二级生物安全实验室要求,具备生物安全柜。 *.凡该样本在检测过程中发生的污染和各类纠纷,后果由服务商承担。 *.★ 服务商负责样品运输,样本运输必须在带冰条件下运输。运输过程中造成的损失、污染、及各类纠纷,后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。 *.样本交接:根据采购方的要求,在**壮族自治区疾病预防控制中心不定期进行标本交接。 *.服务商及技术服务公司未经采购方同意,不能将剩余样本另作他用或转让给第三方使用,根据采购方要求进行保存返回或按照相关规定处理。 ① PCR产物测序使用的试剂应具备中华人民**国医疗器械注册证(体外诊断试剂)或者为成熟的商业化试剂盒,使用的测序仪应具备中华人民**国医疗器械注册证或者为成熟的商业化测序平台。 ② 实验过程必须严格按照试剂说明书进行操作;在PCR产物质量过关的前提下,中标供应商须对每批样本测序实验进行质控,不可出现实验交叉污染、样本弄混等严重错误;出现此类错误导致的一切成本损耗皆由其负责。 ③ 参与投标的供应商须具备纯化PCR产物的能力,并保证PCR产物符合测序要求;接收到待检样本后至建库测序数据产出,应有严格的质控标准;具有短期处理大量样本,进行一代测序的经验;不得将测序服务转包第三方公司。 ④ 样本收取及运输管理:按照《可感染人类的高致病性病原微生物菌(毒)种或样本运输管理规定》的运输管理规范进行标本运输,根据采购人指定的时间、地点,由中标供应商上门收样后将样本运回实验室。 ⑤ 采购人对检测调查结果拥有所有权,供应商对检测调查结果负有保密义务,仅提供给采购人或采购人指定的人员;未经采购人许可,不得对第三方泄露检测信息,不得在报刊杂志上发表或作其他任何用途的引用。 ⑥ 中标供应商应在样本接收后及时对PCR产物进行质检,将结果反馈给采购人;所有未使用完的样本应免费保存至少*个月,并在必要时返回原样。剩余样本未经采购人同意不能将另作他用、转让给第三方使用或应按照相关规定高压后处理。 (六)服务地点:检测服务在中标供应商的实验室内完成。 (七)采购预算:*.**万元,其中菌株全基因组测序为***元/株、一代测定为**元/反应。 (八)报价要求:包括:服务的价格;必要的保险费用和各项税金;运输、装卸、安装、调试、培训、技术支持、售后服务、税金及其它所有成本费用的总和。 采购项目的名称、数量、简要规格描述详见附件报价表,须用使用统一格式报价表,否则投标无效。 (九)付款条件:按中标实际单价、实际检测并验收合格的份数进行结算。 (十)采购结果认定:满足采购需求的前提下最低价中标,超出预算的投标视为无效。 二、资格要求及条件 *.投标人须是国内注册企事业单位,拥有独立法人资格,具有有效的营业执照、税务登记证、组织机构代码、技术服务许可证、医疗机构执业许可证》、生物安全II级实验室备案证明。 *.检测实验室必须已开展测序服务实验(提供复印件,原件备查)并承诺独立完成本项目,不得转让或转包或分包。 *.投标人须符合《政府采购法》第二十二条规定的条件; *.投标人在“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn)或中国政府采购网(www.ccgp.gov.cn)查询相关供应商主体信用记录,将查询结果加盖投标人单位公章提交(必须提供,如为事业单位及高校可不提供); *.服务工作周期:签订合同之日起到****年*月**日。如连续三次未及时反馈结果,采购方有权拒绝支付相应费用。 *.具有履行合同所必需的人员和专业服务能力; *.国家法律、法规规定的其他要求; *.验收方式: 供应商提供的成果包含提供的成果包含出具检测原始数据、汇总结果(Excel文件列出标本名称以及对应的各指标结果)、样本接收单等进行验收。 *.付款方式 按实际检测份数及项目报价单价结算,采购人收到并对结果无异议,凭验收单中的检测实际数量,根据供应商开具相应发票,在**个工作日内支付全部的费用。采购人对发票有异议的,应在收到发票后*日内向供应商提出异议,双方协商解决。 **.其他:应统一按附件报价表进行报价,不能恶意低价投标。 **.投标人根据报价表填写拟采购项目相关信息及价格一同密封提交(资格要求及条件材料装订成册)。闭封袋密封处需加盖递交单位公章,密封文件袋封面须注明产品名称,递交公司全称(信封密封口盖骑缝章)。 三、投送材料截止时间、地点 *.截止日期:****年*月**日下午**点; *.截止地点:***青秀区金洲路**号**疾病预防控制中心行政楼*楼***号房。采购管理科联系人及电话:蒙婧婷、李杰文****-*******。 fw-***统一报价表.xlsx **壮族自治区疾病预防控制中心 ****年*月**日
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