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关于“一代测序服务”等项目竞争性谈判前公示-华中科技大学协和深圳医院

信息发布日期:2022.05.12 标签: 广东省招标 深圳市招标 大学招标 医院招标 
加入日期:2022.05.12
招标业主:深圳市南山人民医院
地 区:深圳市
内 容:根据华中科技大学协和**医院院内采购相关规定,拟对感染科科提交的以单一来源采购方式采购“一代测序服务”等项目进行谈判前公示。具体内容如下: *、采购项目名称: ①一代测序服务; ②引物合成(*-*OD,**-**nt); ③细菌基因组重测序; ④细菌基因组初级组装测序; ⑤细菌基因组完成图测序; ⑥
关键词: 大学 医院
 
招标公告正文

根据华中科技大学协和深圳医院院内采购相关规定,拟对感染科科提交的以单一来源采购方式采购“一代测序服务”等项目进行谈判前公示。具体内容如下:

1、采购项目名称:

①一代测序服务;

②引物合成(2-4OD,15-49nt);

③细菌基因组重测序;

④细菌基因组初级组装测序;

⑤细菌基因组完成图测序;

⑥细菌转录组测序;

 2、项目采购预算金额:

服务项目

项目单价(人民币元/个)

样品数

招标参数备注

一代测序服务

18元/反应

按项目需求

1、可以提供常规测序、菌种鉴定测序、PCR重测序、STR 分型等检测服务。 2、检测周期:常规测序收到样品24h内发送测序结果。3、所有测序数据及其分析结果版权归华中科技大学协和深圳医院所有,公司参与人员对实验室数据全程保密。

引物合成

(2-4OD,15-49nt)

1元/碱基(PAGE 纯化)

按项目需求

1、分子量差异≤0.05%;

2、准确定量及分装,分装误差≤10%;

3、本类别引物由广东省内基地生产,满足24点前均可接收订单,且交付时间满足非批量引物次日可发货的要求;

4、采用自主研发的生产管理系统,且使用自有服务器存储数据。

5、采用进口高品质核心试剂,实验过程可监控。

细菌基因组重测序

600元/样本

按项目需求

数据量要求:PE150测序;原始数据量(碱基数)≥1.5G;Q20高质量数据量(Clean data)≥1G;质量要求:基因组覆盖度≥95%,基因区覆盖度≥98%,整体覆盖深度≥100×,碱基数据质量值Q30比例≥85%,单碱基错误率低于十万分之一。

细菌基因组初级组装测序

600元/样本

按项目需求

数据量要求:PE150测序;原始数据量(碱基数)≥1.5G;Q20高质量数据量(Clean data)≥1G;质量要求:基因组覆盖度≥95%,基因区覆盖度≥98%,整体覆盖深度≥100×,碱基数据质量值Q30比例≥85%,单碱基错误率低于十万分之一。

细菌基因组完成图测序

2400元/样本

按项目需求

数据量要求:原始数据量(碱基数)≥750M;Q20高质量数据量(Clean data)≥600M;质量要求:基因组覆盖度100%,基因区覆盖度100%,整体覆盖深度≥100×,碱基数据质量值Q30比例≥85%,基因组完全合并,Contig数量1个,单碱基错误率低于十万分之一。

细菌转录组测序

1600元/样本

按项目需求

采用优化的联合探针锚定聚合技术(cPAS)和独有的DNA纳米球(DNB)核心测序技术,结合芯片位点阵列化排布(Pattern Array)技术和高分辨率成像系统,对RNA样品进行定量分析,每个样品产出20M 以上clean reads,总数据量产出2Gb以上,Q30比例80%以上。原核RNA需要增加去除rRNA步骤

 

3、采购项目描述:

感染科在进行三名工程建设、实验室建设、科创委项目、国家和省市级项目及重点学科工作任务等过程中,需要进行分子克隆构建载体,对合成引物以及对DNA序列进行一代测序鉴定,同时需要细菌基因组重测序和组装以及细菌转录组的研究和分析

4、拟定服务商名单:

(1)北京六合华大基因科技有限公司广州分公司

(2)北京诺禾致源科技股份有限公司

(3)深圳市星系生物科技有限公司

5、项目需求:

本课题组主要开展抗生素和生物被膜研究,需要开展PCR相关的引物合成和sanger测序、各类病原菌的全基因测序、转录组测序、完成图拼接、短片段sanger测序分析及相关生物信息分析检测。

6、情况公示期限:2021年5月12日起至2022年5月14日止。

7、拟定谈判时间:2022年5月16日14:30时。

8、地址:***

9、采购人联系方式:华中科技大学协和深圳医院采购办公室,联系电话***

备注:如对此公示有异议,可于公示期内,以书面形式向华中科技大学协和深圳医院招标委员会反映,逾期将不再受理。

华中科技大学协和深圳医院招标委员会

                                                                      2022年5月12日


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