加入日期: | 2022.05.12 |
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招标业主: | 深圳市南山人民医院 |
地 区: | 深圳市 |
内 容: | 根据华中科技大学协和**医院院内采购相关规定,拟对感染科科提交的以单一来源采购方式采购“一代测序服务”等项目进行谈判前公示。具体内容如下: *、采购项目名称: ①一代测序服务; ②引物合成(*-*OD,**-**nt); ③细菌基因组重测序; ④细菌基因组初级组装测序; ⑤细菌基因组完成图测序; ⑥ |
关键词: | 大学 医院 |
根据华中科技大学协和深圳医院院内采购相关规定,拟对感染科科提交的以单一来源采购方式采购“一代测序服务”等项目进行谈判前公示。具体内容如下:
1、采购项目名称:
①一代测序服务;
②引物合成(2-4OD,15-49nt);
③细菌基因组重测序;
④细菌基因组初级组装测序;
⑤细菌基因组完成图测序;
⑥细菌转录组测序;
2、项目采购预算金额:
服务项目 |
项目单价(人民币元/个) |
样品数 |
招标参数备注 |
一代测序服务 |
18元/反应 |
按项目需求 |
1、可以提供常规测序、菌种鉴定测序、PCR重测序、STR 分型等检测服务。 2、检测周期:常规测序收到样品24h内发送测序结果。3、所有测序数据及其分析结果版权归华中科技大学协和深圳医院所有,公司参与人员对实验室数据全程保密。 |
引物合成 (2-4OD,15-49nt) |
1元/碱基(PAGE 纯化) |
按项目需求 |
1、分子量差异≤0.05%; 2、准确定量及分装,分装误差≤10%; 3、本类别引物由广东省内基地生产,满足24点前均可接收订单,且交付时间满足非批量引物次日可发货的要求; 4、采用自主研发的生产管理系统,且使用自有服务器存储数据。 5、采用进口高品质核心试剂,实验过程可监控。 |
细菌基因组重测序 |
600元/样本 |
按项目需求 |
数据量要求:PE150测序;原始数据量(碱基数)≥1.5G;Q20高质量数据量(Clean data)≥1G;质量要求:基因组覆盖度≥95%,基因区覆盖度≥98%,整体覆盖深度≥100×,碱基数据质量值Q30比例≥85%,单碱基错误率低于十万分之一。 |
细菌基因组初级组装测序 |
600元/样本 |
按项目需求 |
数据量要求:PE150测序;原始数据量(碱基数)≥1.5G;Q20高质量数据量(Clean data)≥1G;质量要求:基因组覆盖度≥95%,基因区覆盖度≥98%,整体覆盖深度≥100×,碱基数据质量值Q30比例≥85%,单碱基错误率低于十万分之一。 |
细菌基因组完成图测序 |
2400元/样本 |
按项目需求 |
数据量要求:原始数据量(碱基数)≥750M;Q20高质量数据量(Clean data)≥600M;质量要求:基因组覆盖度100%,基因区覆盖度100%,整体覆盖深度≥100×,碱基数据质量值Q30比例≥85%,基因组完全合并,Contig数量1个,单碱基错误率低于十万分之一。 |
细菌转录组测序 |
1600元/样本 |
按项目需求 |
采用优化的联合探针锚定聚合技术(cPAS)和独有的DNA纳米球(DNB)核心测序技术,结合芯片位点阵列化排布(Pattern Array)技术和高分辨率成像系统,对RNA样品进行定量分析,每个样品产出20M 以上clean reads,总数据量产出2Gb以上,Q30比例80%以上。原核RNA需要增加去除rRNA步骤 |
3、采购项目描述:
感染科在进行三名工程建设、实验室建设、科创委项目、国家和省市级项目及重点学科工作任务等过程中,需要进行分子克隆构建载体,对合成引物以及对DNA序列进行一代测序鉴定,同时需要细菌基因组重测序和组装以及细菌转录组的研究和分析
4、拟定服务商名单:
(1)北京六合华大基因科技有限公司广州分公司
(2)北京诺禾致源科技股份有限公司
(3)深圳市星系生物科技有限公司
5、项目需求:
本课题组主要开展抗生素和生物被膜研究,需要开展PCR相关的引物合成和sanger测序、各类病原菌的全基因测序、转录组测序、完成图拼接、短片段sanger测序分析及相关生物信息分析检测。
6、情况公示期限:2021年5月12日起至2022年5月14日止。
7、拟定谈判时间:2022年5月16日14:30时。
8、地址:***
9、采购人联系方式:华中科技大学协和深圳医院采购办公室,联系电话***
备注:如对此公示有异议,可于公示期内,以书面形式向华中科技大学协和深圳医院招标委员会反映,逾期将不再受理。
华中科技大学协和深圳医院招标委员会
2022年5月12日