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基于组学解析爪哇香茅精油代谢关键调控基因（重招）服务项目询价邀请公告
招标文件下载 - 信息发布日期：2021.11.05 标签： 广东省招标
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加入日期： 2021.11.05 截止日期： 2021.11.11 地 区： 广东省 内 容： **学院招标与投标中心受**学院英东生物与农业学院的委托，对基于组学解析爪哇香茅精油代谢关键调控基因（重招）进行询价采购，欢迎符合资格条件的供应商参加。 一、采购项目编号：SGXY(询)******* 二、采购项目名称：基于组学解析爪哇香茅精油代谢关键调控基因（重招） 三、项目预算：*****元 -
招标公告正文
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韶关学院招标与投标中心受韶关学院英东生物与农业学院的委托，对基于组学解析爪哇香茅精油代谢关键调控基因（重招）进行询价采购，欢迎符合资格条件的供应商参加。
一、采购项目编号： SGXY(询)2021100
二、采购项目名称：基于组学解析爪哇香茅精油代谢关键调控基因（重招）
三、项目预算：49600元
四、供应商资格：
报价人应具备《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定的条件。并提供以下材料：
1. 供应商应具备相关生产或经营范围的营业执照或者事业单位法人证书（复印件加盖公章，营业执照或法人证书范围必须包含进行科技咨询资格）。
2. 供应商须具有丰富的香茅或近缘物种（高粱、甘蔗）转录组数据处理经验，有成功的高粱、甘蔗转录组-代谢组整合分析案例，并积累大量的香茅近缘物种基因功能注释信息数据，应具有代谢物关键基因在植物、酵母或大肠杆菌中的基因功能验证实验体系与相关论文发表经历（具有高粱或甘蔗中高水平转录组、代谢组数据文章优先）。
五、投标报名：符合资格的供应商应当在2021年11 月 10 日17时前将报名表（附件中下载）、营业执照（复印件加盖公章）、法人证明书、法人授权委托书（如有）等材料原件扫描在PDF文件中，发送至sgxyzbzx@sgu.edu.cn电子邮箱***
六、符合资格的供应商应当在2021年11月11日12时前将报价方案（含报价表【自行设计制作】、工商营业执照、服务方案、承诺、报名通过回执及联系方式等）一式三份密封盖章后邮寄送达我院招标与投标中心【同时需提供投标文件电子档（PDF格式），将投标文件放在存储设备（U盘或光盘）中，连同投标文件一起密封邮寄。】。所需证件必须为复印件加盖单位公章，投标文件封面需注明投标项目及公司名称。联系地址***
七、招标货物名称、数量及主要规格及要求：
1. 项目购置清单
项目名称
技术目标
技术内容
基于组学解析爪哇香茅精油代谢关键调控基因（重招）
乙方基于甲方提供的爪哇香茅（Cymbopogon winterianus）植物材料，根据乙方掌握的代谢物提取与分析技术、转录组-代谢组联合分析技术，结合乙方的代谢物关键基因研究经验和功能研究体系，按照甲方的要求进行爪哇香茅转录组解析、精油特征代谢物的成分鉴定以及这些代谢物的关键调控基因的研究。
基于甲方提供的爪哇香茅植物材料，乙方利用代谢物提取与分析技术、转录组-代谢组整合分析技术，结合代谢物关键基因研究经验和功能研究体系，构建爪哇香茅全长转录组，并通过转录组-代谢组联合分析技术鉴定爪哇香茅叶片精油中主要代谢成分的关键调控基因。具体研究内容如下：
(1) 根据甲方提供的爪哇香茅植物材料的不同组织部位进行RNA提取，通过PacBio Iso-seq技术开展不同组织部位混样全长转录组的检测和数据解析；要求PacBio Iso-seq使用多转录本长度建库策略混样测序策略，数据总产出不低于300G，Subreads平均长度不低于3.5 kb；要求PacBio Iso-seq技术服务提供数据质控，全长转录本构建与功能注释；
(2) 根据甲方提供的爪哇香茅植物材料的8个组织部位和发育时期开展常规RNA-seq测序并基于全长转录组数据对爪哇檬香茅上述组织中的基因表达进行转录组学分析；常规RNA-seq测序单个样本测序的目标数据量为6G，实际测序数据量不得低于5.5G，平均Q20大于90%，平均Q30大于85%；要求常规RNA-seq技术服务提供数据质控，全长转录组比对分析，UTR区域的变异分析，基因表达水平分析，样本间差异表达基因分析，所有样本的主成分分析和聚类特图分析，样本间重复性分析，差异表达基因的鉴定、注释、富集分析和个性化代谢关键基因的通路分析，共表达网络分析和精油代谢相关基因模块鉴定。
(3) 根据甲方提供的爪哇香茅植物材料选取3~5个代表性组织开展精油代谢物的蒸馏提取和基于气相色谱-质谱连用（GC-MS）的代谢物靶向鉴定与主要精油代谢物的含量测定；
(4) 根据乙方的代谢物关键基因鉴定经验，联合分析转录组和精油代谢组数据，鉴定精油代谢通路相关基因以及关键基因；
(5) 对精油代谢通路中关键的3~4个基因家族开展家族成员鉴定与表达分析，揭示爪哇香茅精油代谢关键基因家族的进化生物学变化及其与精油代谢物种特异性的关联；
(6) 基于上述研究与组学数据挖掘，成功地在原核（大肠杆菌）、真核（酵母）体系或植物体系开展至少1~3个决定爪哇香茅精油主要成分的关键代谢基因的代谢功能研究；
(7) 数据整理和分析。并协助甲方依据技术服务中的结果与解读参与相关科研论文的撰写与修订。
2. 基本要求: 乙方基于甲方提供的转录组数据，根据乙方掌握的香茅近缘物种（高粱、甘蔗）的基因组和各种功能基因注释信息，进行资源整合并映射到爪哇香茅转录组，结合乙方自己的转录组-代谢组整合分析流程与经验，按照甲方的要求开发适用于爪哇香茅转录组的生物信息学分析方法，建立个性化分析流程，获得具有生物学意义的数据分析结果。
3. 服务要求: 根据乙方掌握的香茅近缘物种（高粱、甘蔗）的基因组和各种功能基因注释信息，进行资源整合并映射到爪哇香茅转录组，形成爪哇香茅转录组特异的、多来源的功能注释信息，基于此开发爪哇香茅转录组数据生物信息学个性化分析技术，对24份（包含3个生物学重复）爪哇香茅转录组及PacBio Iso-seq全长转录组数据开展生物信息学分析，结合香茅精油靶向代谢组数据进行整合分析、鉴定精油代谢相关的基因，针对关键的基因家族开展家族鉴定并在原核、真核或高等植物体系中开展精油代谢关键基因的初步功能验证实验。及时与甲方进行沟通交流并完成甲方所需的数据呈现方式。
八、采购项目商务要求
带“★”条款为实质性响应条款，没有完全响应或负偏离将做无效投标处理。
(1) 供货要求： 按照用户指定的时间地点免费送货上门。
(2) 经验要求： 须具有丰富的香茅或近缘物种（高粱、甘蔗）转录组数据处理经验，有成功的高粱、甘蔗转录组-代谢组整合分析案例，并积累大量的香茅近缘物种基因功能注释信息数据，应具有代谢物关键基因在植物、酵母或大肠杆菌中的基因功能验证实验体系与相关论文发表经历（具有高粱或甘蔗中高水平转录组、代谢组数据文章优先）。
(3) 项目预算： 49,600.00元。
(4) 报价要求：投标人按照用户需求完全响应进行报价，报价报单价和总价。
(5) 完工期： 100天内完成约定分析内容。
(6) 质保期（服务期）： 提供数据后1年。
(7) 验收要求： 结果符合数据分析质量要求。
(8) 售后服务： 提供项目数据其他的呈现方式，在提供数据的1年内（质保期内）响应甲方对本项目数据所提出的个性化生信分析需求，提供针对性的数据个性化分析、呈现或重分析；在提供数据后的2年内协助甲方参与相关科研论文的撰写与修订。
(9) 付款方式： 有效签订合同后，一次性支付。
九、定标原则
对提供产品质量、服务均能满足采购需求规定要求的供应商归列为推荐成交的候选对象，采购人依照候选供应商的报价顺序，以有效报价最低者确定为成交供应商（第一次询价挂网，通过资格性符合性审查的供应商不足3家则废标）。如有两家或以上投标供应商相同报价最低的情况，则由评审小组在最低报价的投标供应商中投票决定成交供应商。
十、联系地址***
联系人***
联系电话***
韶关学院网址：WWW.SGU.EDU.CN
我院所有近期招标公告、招标结果均会在此网址公布。
韶关学院招标与投标中心
2021年11月5日
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