加入日期: | 2021.02.24 |
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截止日期: | 2021.03.01 |
地 区: | 青岛市 |
内 容: | 海军第九七一医院所需招募课题研究基因测序分析检测服务公司项目竞争性谈判公告 项目名称:海军第九七一医院所需招募课题研究基因测序分析检测服务公司项目 报名时间:自本公告发布之日起至****年*月*日 海军第九七一医院所需招募课题研究基因测序分析检测服务公司项目进行竞争性谈判采购,欢迎符 |
关键词: | 医院 |
海军第九七一医院所需招募课题研究基因测序分析检测服务公司项目竞争性谈判公告
项目名称:海军第九七一医院所需招募课题研究基因测序分析检测服务公司项目
报名时间:自本公告发布之日起至2021年3月1日
海军第九七一医院所需招募课题研究基因测序分析检测服务公司项目进行竞争性谈判采购,欢迎符合条件的供应商参加报名。
一、项目概况:
采购内容:海军第九七一医院所需招募课题研究基因测序分析检测服务公司
项目内容 测试参数 数目(个)
引物合成(PAGEPLUS纯化) 常规引物合成服务: 2400bp
低突变率:低于1/1000
快速发货:常规引物合成周期为24小时
技术反馈:技术支持反馈时间保证1小时以内
高度定制化:提供0.5-100OD的规格,脱盐到HPLC等四种纯化方式任选
sanger法常规测序 1.DNA纯化,DNA测序(报价应为切胶回收、DNA纯化和1个测序反应的总费用); 100
2、数据质量要求:所产生的数据质量Q20≥85%,Q30≥80%;
3、每个反应至少保证800bp的有效长度;
4、若样品长度为1.3~7kb,能够设计、合成Walking引物完成测序。
5、测序完成后,对每个样品提供一份测序报告,其中包括测出的序列彩色峰图,序列文件和拼接后结果(需要测通的样品);
16SrDNA测序 对提供的80个样品进行检测,检测合格后根据制定方案进行大规模信息采集,完成信息采集后对数据进行拼接和相应的生物信息分析工作。
数据处理:1.去除低质量及含有接头(adapter)、读N碱基等的reads2.产出数据及质控统计3.Paired-endreads拼接为tags4.去除引物序列(标准信息分析1-4条需整体提供)物种组成和丰度分析:5.OTU及其丰度分析:OTU聚类,默认所有样本一起聚OTU;OTU韦恩(2≤样本数或组数≤5),默认绘制1张韦恩图OUTPCA分析(可选PLS-DA分析,NMDS分析),默认PCA分析;OTURank曲线,包含所有样本的Rank曲线图;6.物种及其丰度分析:物种注释(门、纲、目、科、属、种分类水平绘制物种profiling柱状图),每个分类水平各绘制1张柱状图;物种热图分析(门、纲、目、科、属、种分类水平绘制热图);
物种系统进化分析(属分类水平绘制系统进化树)。样品复杂度分析:7.单个样品复杂度分析((组别≥2,每组样品数≥3))
默认对5个alpha多样性指数obs、chao、ace、shannon、simpson进行统计8.样品间复杂度比较分析(n≥4)(基于1-6分析结果)Beta多样性分析、Beta多样性热图、Beta多样性PCoA分析、不同样品物种组成聚类分析对Beta多样性指数:weightedUniFrac、unweightedUniFrac、Bray-Curtis进行计算;
基于3个beta多样性指数绘制包含所有样本的beta多样性热图,PCoA图和聚类图9.样品组间显著性差异因子(物种)分析(组别≥2,每组样品数≥3)(基于1-6分析结果)样品组间差异物种分析、相似性分析检验分析(ANOSIM)、多元方差分析(PERMANOVA)10.LEfSe组间群落差异分析11.16S测序样品功能预测/差异分析,利用软件PICRUSt进行分析。完成规定数量样品的扩增子测序,每个样品的测序数据量不低于合同的规定。
完成合同规定的信息分析内容,提供项目结题报告。
测序过程中产生的序列文件*.fq(或*.fa)和相关生物信息分析结果文件,如果数据量小于50G,使用FTP服务器提供;因网络等原因无法顺利下载的,可直接传输至移动硬盘。如果数据量大于50G,所有数据将会使用移动硬盘传输数据。
数据交付6个月内,提供免费的项目咨询服务。最终数据提供后,可继续保留数据3个月 80
二、供应商资格要求:
符合《政府采购法》第二十二条的资格条件:
(一)具有独立承担民事责任的能力;
(二)具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度;
(三)具有履行合同所必需的设备和专业技术能力;
(四)有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录;
(五)在经营活动中没有违法记录;
(六)法律、行政法规规定的其他条件。
三、供应商报名时间、地点及须提供的资料:
(一)报名时间:自本公告发布之日起至2021年3月1日
(二)报名地点:海军第九七一医院机关楼2楼204室
(三)报名时须提供的资料:
指定专人到现场报名或邮寄方式。报名时须提供下述材料加盖单位公章的复印件1份。
1.营业执照(包含本项目内容);
2.税务登记证;
3.法定代表人授权书(含法定代表人和被授权人身份证复印件)。
四、谈判方式、时间及地点:
(一)谈判方式:现场谈判
(二)谈判时间:时间另行通知
(三)谈判地点:海军第九七一医院机关楼1楼会议室
五、联系方式***
联系单位名称:海军第九七一医院卫勤处
地址:***
电话:***
海军第九七一医院
2021年2月24日